Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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