Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tomm40Q9QYA2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tomm40Q9QYA2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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