Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms