Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms