Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms