Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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