Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AatfQ9JKX4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms