Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp39a1Q9JKJ9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms