Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms