Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efcc1Q9JJF6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efcc1Q9JJF6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms