Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms