Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms