Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc12a4Q9JIS8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc12a4Q9JIS8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms