Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
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Rb1cc1Q9ESK9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
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Rb1cc1Q9ESK9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rb1cc1Q9ESK9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
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