Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Cxcr6Q9EQ16 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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