Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnft1Q9DCN7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms