Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms