Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms