Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Snx5Q9D8U8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Snx5Q9D8U8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx5Q9D8U8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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