Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms