Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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