Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shisa5Q9D7I0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Shisa5Q9D7I0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Shisa5Q9D7I0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Shisa5Q9D7I0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Shisa5Q9D7I0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Shisa5Q9D7I0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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