Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms