Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms