Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec23bQ9D662 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms