Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms