Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D2Q3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms