Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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