Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms