Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SarnpQ9D1J3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms