Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms