Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx56Q9D0R4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx56Q9D0R4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms