Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf146Q9CZW6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf146Q9CZW6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf146Q9CZW6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf146Q9CZW6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf146Q9CZW6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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