Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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