Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms