Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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