Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms