Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms