Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Tmed6Q9CQG0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Tmed6Q9CQG0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Tmed6Q9CQG0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Tmed6Q9CQG0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Tmed6Q9CQG0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Tmed6Q9CQG0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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