Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NenfQ9CQ45 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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NenfQ9CQ45 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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NenfQ9CQ45 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NenfQ9CQ45 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms