Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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