Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Commd4Q9CQ02 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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