Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms