Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl17Q9CPR4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms