Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx4Q99NE9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx4Q99NE9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pbx4Q99NE9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx4Q99NE9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx4Q99NE9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx4Q99NE9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx4Q99NE9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx4Q99NE9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pbx4Q99NE9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pbx4Q99NE9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbx4Q99NE9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms