Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GsdmcQ99NB5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms