Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ms4a4dQ99N05 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ms4a4dQ99N05 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ms4a4dQ99N05 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ms4a4dQ99N05 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ms4a4dQ99N05 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ms4a4dQ99N05 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a4dQ99N05 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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