Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms