Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms