Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms